В 1916 году священника Феодора перевели в клир соборной церкви в городе Троицк Краснослободского уезда, сейчас это территория Мордовии. В 1922 году Феодор Каллистов был возведён в сан протоиерея.
В 1930-ые годы власти делали всё, чтобы закрыть церковь в Троицке. Отца Феодора обвиняли в антисоветской и антиколхозной агитации и в конце концов приговорили его к ссылке в Западную Сибирь сроком на три года. После трёх лет ссылки протоиерей Феодор Каллистов вернулся в Троицк и возобновил богослужения. Однако обвинения и доносы продолжились. 14 августа 1937 года отец Феодор был арестован, а 3 сентября его расстреляли.
Ходатайство о канонизации подал митрополит саранский и мордовский Зиновий. На заседании священного Синода, которое состоялось 29 октября, было решено включить имя протоиерея Феодора Каллистова в собор новомучеников и исповедников.