В нарушение ветеринарного законодательства работниками Службы и подведомственными районными станциями по борьбе с болезнями животных не проведено эпизоотологическое и лабораторно-бактериологическое обследование неиспользуемых скотомогильников, подлежащих ликвидации. По этой причине в отношении 100 из 176 (около 60 %) неиспользуемых скотомогильников в Ельниковском, Зубово-Полянском, Кадошкинском, Краснослободском, Ромодановском, Старошайговском, Темниковском, Теньгушевском и других районах решения о ликвидации до настоящего времени не приняты.
Ведомством не исполняются требования о передаче в течение дня, следующего за днём подписания акта о снятии скотомогильника с ветеринарного учёта, копий ветеринарно-санитарных карточек в Управление Роспотребнадзора по Республике Мордовия, что препятствует надлежащему учёту и систематизации информации о санитарно-эпидемиологическом благополучии мест захоронения таких отходов.
Допускаются нарушения при выдаче заключений о соответствии ветеринарным нормам и правилам размещения на земельных участках животноводческих предприятий.
На низком уровне Службой подготовлен проект плана проведения проверочных мероприятий юридических лиц и индивидуальных предпринимателей на 2015 г. Так, вопреки требованиям Федерального закона «О защите прав юридических лиц и индивидуальных предпринимателей при осуществлении государственного контроля (надзора) и муниципального контроля» в проект плана были включены проверки юридических лиц и индивидуальных предпринимателей, исключённых из Единых государственных реестров, допускалось неверное указание наименования, ИНН и ОГРН проверяемого лица, адреса нахождения и фактического осуществления деятельности, планирование проверок на выходные и праздничные дни, неуказание даты начала проведения проверок, нарушение периодичности проведения плановых проверок и др., что повлекло исключение из проекта плана 209 проверок из 441 (47 %).
Не отвечают предъявляемым требованиям и направляемые в прокуратуру республики материалы о согласовании проведения внеплановых выездных проверок юридических лиц и индивидуальных предпринимателей. Так, из 12 поступивших в 2014 г. заявлений о согласовании проведения проверок прокуратурой республики в согласовании 10 отказано, что составляет 83 %.
Имели место факты ненадлежащего оформления распоряжений и актов проведения проверок, нарушений законодательства об административных правонарушениях.
Отделом государственной ветеринарной инспекции Службы ненадлежащим образом осуществляются полномочия по организации, координации и контролю за деятельностью главных государственных ветеринарных инспекторов в районах республики.
По результатам проверки заместителем прокурора республики руководителю ведомства внесено представление. По результатам его рассмотрения приняты меры к устранению нарушений закона, виновные должностные лица привлечены к дисциплинарной ответственности.